Il s'agit de l'application Linux nommée CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 est maintenant disponible] dont la dernière version peut être téléchargée sous CSBB-v3.0.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 est maintenant disponible] avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
CAPTURES D'ÉCRAN:
CSBB-v2.1 [CSBB-v3.0 est maintenant disponible]
DESCRIPTION:
CSBB est une suite bioinformatique basée sur la ligne de commande pour analyser les données biologiques acquises par diverses voies d'expériences biologiques. CSBB est implémenté en Perl, tout en tirant parti de l'utilisation de R, Java et Ruby en arrière-plan pour des modules spécifiques. L'objectif principal de CSBB est de permettre aux utilisateurs de la communauté de la biologie et de la bioinformatique de bénéficier de l'exécution de tâches d'analyse en aval tout en éliminant le besoin d'écrire du code de programmation. CSBB est actuellement disponible sur les plateformes Linux, UNIX et Windows.
Actuellement, le CSBB propose 17 modules axés sur des tâches analytiques telles que la normalisation, la visualisation, les statistiques, l'ARN-SEQ, etc.
Fonctionnalités:
- ARN-SEQ
- Expression différentielle
- Visualisation interactive
- Statistiques
- Interaction Protéine Protéine
- Normalisation
- Autres utilitaires
- Open source
- Utilisation grand public
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Perl
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/csbb-v2-1/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.