Il s'agit de l'application Linux nommée Protein Cavity Search dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom de cavité-search-0.21.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne gratuitement cette application nommée Protein Cavity Search avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez l'émulateur en ligne OnWorks Linux ou Windows en ligne ou l'émulateur en ligne MACOS à partir de ce site Web.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Linux que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application, installez-la et exécutez-la.
Recherche de cavité protéique
DESCRIPTION:
Logiciel pour identifier les cavités et les crevasses dans les protéines. L'objectif est de pouvoir prendre une structure protéique, et de différencier cinq types d'environnements différents pour chaque résidu : enterré, superficiel, interfacial, cavité ou crevasse.
Fonctionnalités:
- Calculer les volumes des cavités internes
- Déterminer l'environnement des résidus ionisables
- Calculer la profondeur d'enfouissement des résidus ionisables
- Calculer la densité de tassement pour les résidus ionisables
Audience
Science / Recherche
Interface utilisateur
Ligne de commande
Langage de programmation
Python
Catégories
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/cavity-search/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.