Il s'agit de l'application Windows nommée 3DScape dont la dernière version peut être téléchargée sous le nom 3DScapeCS.jar. Il peut être exécuté en ligne sur le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée 3DScape avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
3Dscape
DESCRIPTION:
3DScape est le premier plug-in qui permet la visualisation de réseau en trois dimensions dans Cytoscape. Les fonctionnalités de 3DScape incluent l'accès à l'apparence du graphique, à l'algorithme de mise en page et aux effets d'animation sur une série de données d'expression.Fonctionnement
- Convertissez la vue du réseau Cytoscape en 3D, en conservant la couleur, la taille et la forme des nœuds.
- Disposition tridimensionnelle à l'aide des algorithmes Fruchterman-Reingold (Fruchterman et al., 1991), Fast Multipole Multilevel Method (FM3) (Hachul et al., 2004) et Span Tree.
- Les bords du réseau peuvent être rendus dans des couleurs dégradées de carte thermique, avec un effet lumineux.
- Boucles d'animation à partir de points temporels d'une série de données d'expression.
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée à partir de https://sourceforge.net/projects/scape3d/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.