Il s'agit de l'application Windows nommée GenOO-HTS qui s'exécute sous Windows en ligne sur Linux en ligne dont la dernière version peut être téléchargée sous genoo-code-2013_04_18.tar.gz. Il peut être exécuté en ligne chez le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée GenOO-HTS pour fonctionner gratuitement sous Windows en ligne sur Linux en ligne avec OnWorks.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN:
GenOO-HTS pour fonctionner sous Windows en ligne sur Linux en ligne
DESCRIPTION:
GenOO-HTS [jee-noo] est une source ouverte ; Framework Perl orienté objet spécialement développé pour la conception d'outils d'analyse de séquençage à haut débit (HTS). L'objectif principal de GenOO-HTS est de permettre des analyses HTS simples et des analyses compliquées. GenOO-HTS modélise des entités biologiques dans des objets Perl et fournit des attributs et des méthodes pertinents qui permettent la manipulation de données de séquençage à haut débit. L'utilisation de GenOO-HTS comme module de développement principal réduit les frais généraux et la complexité de la gestion des données et des entités biologiques disponibles. GenOO-HTS a été conçu pour être flexible, facilement extensible avec une structure modulaire et des exigences minimales pour les outils et bibliothèques externes.Fonctionnement
- Organiser les entités biologiques en objets Perl (régions génomiques, gènes, transcrits, introns/exons, etc.)
- Organiser les entités de séquençage en tant qu'objets/attributs Perl (lectures de séquençage, alignements, etc.)
- Facilitez les E/S à partir de formats de fichiers largement utilisés (SAM, BED, FASTA, FASTQ)
- Soyez cohérent et facilement extensible
Audience
Science/Recherche, Développeurs
Langage de programmation
Perl
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/genoo/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.