Il s'agit de l'application Windows nommée MetaPhat -meta-pheno-association-tracker dont la dernière version peut être téléchargée sous plasma_lipids_decomposed.zip. Il peut être exécuté en ligne dans le fournisseur d'hébergement gratuit OnWorks pour les postes de travail.
Téléchargez et exécutez en ligne cette application nommée MetaPhat -meta-pheno-association-tracker avec OnWorks gratuitement.
Suivez ces instructions pour exécuter cette application :
- 1. Téléchargé cette application sur votre PC.
- 2. Entrez dans notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous voulez.
- 3. Téléchargez cette application dans ce gestionnaire de fichiers.
- 4. Démarrez n'importe quel émulateur en ligne OS OnWorks à partir de ce site Web, mais un meilleur émulateur en ligne Windows.
- 5. Depuis le système d'exploitation OnWorks Windows que vous venez de démarrer, accédez à notre gestionnaire de fichiers https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX avec le nom d'utilisateur que vous souhaitez.
- 6. Téléchargez l'application et installez-la.
- 7. Téléchargez Wine depuis les dépôts de logiciels de vos distributions Linux. Une fois installé, vous pouvez ensuite double-cliquer sur l'application pour les exécuter avec Wine. Vous pouvez également essayer PlayOnLinux, une interface sophistiquée sur Wine qui vous aidera à installer des programmes et des jeux Windows populaires.
Wine est un moyen d'exécuter un logiciel Windows sur Linux, mais sans Windows requis. Wine est une couche de compatibilité Windows open source qui peut exécuter des programmes Windows directement sur n'importe quel bureau Linux. Essentiellement, Wine essaie de ré-implémenter suffisamment de Windows à partir de zéro pour qu'il puisse exécuter toutes ces applications Windows sans avoir réellement besoin de Windows.
CAPTURES D'ÉCRAN:
MetaPhat -méta-phéno-association-tracker
DESCRIPTION:
MetaPhat est un programme open source pour détecter les traits de sous-ensemble optimaux sur les associations de SNP principaux à partir des résultats récapitulatifs de plusieurs biomarqueurs GWAS. Les meilleurs traits sont dérivés de la décomposition systématique d'associations multivariées en traits centraux basés sur le BIC optimal et la valeur P des modèles CCA multivariés. Les résultats de trace SNP sont tracés et regroupés pour disséquer et améliorer la spécificité des associations phénotype-génotype mv.
libéré avec la fonction LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Démarrage rapide https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
Contributions https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Exemple Global Lipids https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Citer : Lin et al. (2020) MetaPhat : détection et décomposition d'associations multivariées à partir de statistiques d'association univariées à l'échelle du génome. De face. Genet. doi : 10.
Fonctionnalités:
- analyse multivariée des caractères à l'échelle du génome
- Sélection optimale de sous-ensembles de caractères basée sur la valeur p et le BIC
- tracés de traces de décomposition de traits
- Agglomération de blocs de population et LD
- fichier de résumé du SNP principal et des caractéristiques du conducteur
- cluster de lanceurs de rang de trait snp-snp
Il s'agit d'une application qui peut également être récupérée sur https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. Il a été hébergé dans OnWorks afin d'être exécuté en ligne de la manière la plus simple à partir de l'un de nos systèmes d'exploitation gratuits.