सही_प्रचुरता - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

सही_प्रचुरता - जीनोम प्रचुरता समानता सुधार चरण चलाएँ

SYNOPSIS

सही_बहुतायत नाम

वर्णन

समानता सुधार चरण चलाएँ.

नोट: हालाँकि रीड मैपर्स को हाथ से चलाना या समानता बनाना संभव है
मैट्रिक्स मैन्युअल रूप से, हम प्रदान की गई पायथन स्क्रिप्ट 'run_mappers.py' का उपयोग करने की दृढ़ता से अनुशंसा करते हैं
और 'create_similarity_matrix.py'।

विकल्प

नाम: नाम फ़ाइल का फ़ाइल नाम; सादे पाठ नाम फ़ाइल में प्रति नाम एक होना चाहिए
पंक्ति। नाम का उपयोग संपूर्ण एल्गोरिदम में पहचानकर्ता के रूप में किया जाता है।

-h, --मदद
यह सहायता संदेश दिखाएं और बाहर निकलें

-m एसएमएटी, --समानता-मैट्रिक्स=Smat
समानता मैट्रिक्स फ़ाइल का पथ. समानता मैट्रिक्स उसी के साथ बनाया जाना चाहिए
नाम फ़ाइल. [डिफ़ॉल्ट: ./similarity_matrix.npy]

-s सैम, --samfiles=सैम
मैपर द्वारा बनाई गई एसएएम फ़ाइलों की ओर इशारा करने वाला पैटर्न। नाम के लिए प्लेसहोल्डर
"%s" है. [डिफ़ॉल्ट: ./SAM/%s.sam]

-b गाड़ी की डिक्की, --बूटस्ट्रैप-नमूने=बीओओटी
बूटस्ट्रैप नमूनों की संख्या निर्धारित करें. बूटस्ट्रैपिंग को अक्षम करने के लिए 1 का उपयोग करें [डिफ़ॉल्ट: 100]

-o बाहर, --आउटपुट=बाहर
परिणाम युक्त सादा पाठ आउटपुट फ़ाइल। [डिफ़ॉल्ट: ./results.txt]

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