gmod_fasta2gff3.plp - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

$O - FASTA को सरल GFF3 में बदलें

synopsys

% $O [विकल्प]

कमांड लाइन विकल्प

--fasta_dir निर्देशिका में fasta फ़ाइलें हैं
(डिफ़ॉल्ट: ./fasta)
--gfffilename बनाई जाने वाली GFF3 फ़ाइल का नाम
(डिफ़ॉल्ट: ./out.gff)
-- प्रत्येक सुविधा को असाइन करने के लिए SO प्रकार टाइप करें
(डिफ़ॉल्ट: ईएसटी)
--स्रोत टेक्स्ट स्रोत कॉलम में दिखाई देगा
(गलती करना: ।)
--विशेषताएँ अतिरिक्त टैग=मान जोड़े कॉलम 9 में प्रदर्शित होंगे
--nosequence ##FASTA अनुभाग को दबाएँ (अर्थात्, न करें
डीएनए अनुक्रम प्रिंट करें)

वर्णन

यह स्क्रिप्ट बस फास्टा फ़ाइलों का एक संग्रह लेती है और उन्हें सरल GFF3 में परिवर्तित करती है
चाडो में लोड करने के लिए उपयुक्त।

लेखक

स्कॉट कैनcan@cshl.org>

कॉपीराइट (c) 2006

यह पुस्तकालय मुफ्त सॉफ्टवेयर है; आप इसे पुनर्वितरित कर सकते हैं और/या उसी के अंतर्गत संशोधित कर सकते हैं
पर्ल के रूप में ही शर्तें।

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