आईपिग - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

आईपिग - पीएसएम को जीनोम ब्राउज़र विज़ुअलाइज़ेशन में एकीकृत करना

SYNOPSIS

आईपिग <पीएसएम फ़ाइल> |-जी|-सी|-सीजी [ ]

वर्णन

iPiG मास स्पेक्ट्रोमेट्री से पेप्टाइड स्पेक्ट्रम मैचों (PSMs) के एकीकरण को लक्षित करता है
(एमएस) जीनोम ब्राउज़र द्वारा प्रदान किए गए जीनोमिक विज़ुअलाइज़ेशन में पेप्टाइड पहचान
यूसीएससी जीनोम ब्राउज़र के रूप में (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG MS मानक प्रारूप mzIdentML (*.mzid) से या पाठ प्रारूप में PSM लेता है और
जीनोम ट्रैक प्रारूपों (बीईडी और जीएफएफ3 फाइलों) में परिणाम प्रदान करता है, जिसे आसानी से प्राप्त किया जा सकता है
जीनोम ब्राउज़र में आयात किया गया।

विकल्प

<पीएसएम फ़ाइल>
पेप्टाइड स्पेक्ट्रम मिलान वाली फ़ाइल को इंगित करता है (mzid/txt)

-g, -गुई
iPiG का ग्राफिकल यूजर इंटरफ़ेस शुरू होता है

-c, -नियंत्रण
जीन नियंत्रण प्रारंभ करता है, कॉन्फ़िगरेशन में आवश्यक फ़ाइलों को इंगित करना होगा
पट्टिका

-सीजी, -नियंत्रणगुई
जीन नियंत्रण का ग्राफिकल यूजर इंटरफ़ेस प्रारंभ करता है

-d, -डाउनलोडर
डाउनलोड gui प्रारंभ करता है


एक अलग कॉन्फ़िगरेशन फ़ाइल इंगित की जा सकती है (अन्यथा ipig.conf द्वारा लोड किया गया है)।
चूक)

अतिरिक्त जरूरतें:

गैर-गुई मोड का उपयोग करते हुए, एक कॉन्फ़िगरेशन फ़ाइल (डिफ़ॉल्ट रूप से ipig.conf) में कई शामिल होने चाहिए
अतिरिक्त पैरामीटर, उदाहरण के लिए संदर्भ जीनोम आदि का संकेत देना।

एक गुई मोड में (-g और -सीजी), अतिरिक्त मापदंडों को दो तरीकों से इंगित किया जा सकता है, भीतर
इंटरफ़ेस या कॉन्फ़िगरेशन फ़ाइल के साथ भी।

उदाहरणों और इसके बारे में अधिक जानकारी के लिए readme.txt और ipig.conf पर एक नज़र डालें
अतिरिक्त पैरामीटर

onworks.net सेवाओं का उपयोग करके ऑनलाइन आईपिग का उपयोग करें