मास्केक - क्लाउड में ऑनलाइन

कार्यक्रम:

नाम

मास्केक - नकाबपोश क्षेत्रों के साथ एक क्रम लिखें

SYNOPSIS

मास्केक -अनुक्रम अनुक्रम -क्षेत्र रेंज [-नीचा करना टॉगल] -मस्कचर स्ट्रिंग
-आउटसेक सीकआउट

मास्केक -मदद

वर्णन

मास्केक EMBOSS से एक कमांड लाइन प्रोग्राम है ("यूरोपीय आणविक जीवविज्ञान ओपन
सॉफ्टवेयर सूट")। यह "संपादित करें" कमांड समूह (समूहों) का हिस्सा है।

विकल्प

निवेश अनुभाग
-अनुक्रम अनुक्रम

अपेक्षित अनुभाग
-क्षेत्र रेंज
मुखौटा करने के लिए क्षेत्र। क्षेत्रों का एक समूह पदों के जोड़े के एक समूह द्वारा निर्दिष्ट किया जाता है। NS
पद पूर्णांक हैं। वे किसी भी गैर-अंकीय, गैर-अल्फ़ा वर्ण से अलग होते हैं।
क्षेत्र विनिर्देशों के उदाहरण हैं: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99

अतिरिक्त अनुभाग
-नीचा करना टॉगल
अनुक्रम वर्णों को लोअर-केस में परिवर्तित करके क्षेत्र को 'मुखौटा' किया जा सकता है, कुछ
गैर-EMBOSS कार्यक्रम जैसे फास्टा इसे एक नकाबपोश क्षेत्र के रूप में व्याख्या कर सकता है। क्रम है
केस परिवर्तन के अलावा अपरिवर्तित। आप यह सुनिश्चित करना चाहेंगे कि पूरा क्रम
निर्दिष्ट क्षेत्रों को निम्न-मामले में मास्क करने से पहले ऊपरी-मामले में है
'-सपर' झंडा। डिफ़ॉल्ट मान: नहीं

-मस्कचर स्ट्रिंग
मास्किंग करते समय उपयोग करने के लिए चरित्र। प्रोटीन अनुक्रमों के लिए डिफ़ॉल्ट 'X' है, न्यूक्लिक के लिए 'N'
क्रम यदि मास्क कैरेक्टर को स्पेस कैरेक्टर या अशक्त कैरेक्टर के रूप में सेट किया गया है,
फिर अनुक्रम को 'मुखौटा' किया जाता है, इसे लोअर-केस में बदलकर, जैसा कि के साथ होता है
'-लोअरकेस' ध्वज। डिफ़ॉल्ट मान: @($(acdprotein)?X:N)

उत्पादन अनुभाग
-आउटसेक सीकआउट

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