यह Linux में ऑनलाइन चलने के लिए CPAT नामक Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को Human_coding_transscripts_mRNA.fa.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
ऑनवर्क्स के साथ लिनक्स में ऑनलाइन चलाने के लिए सीपीएटी नामक इस ऐप को मुफ्त में डाउनलोड करें और ऑनलाइन चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
सीपीएटी लिनक्स में ऑनलाइन चलेगा
विवरण:
आरएनए-सीक का उपयोग करके, हजारों उपन्यास प्रतिलेखों और आइसोफोर्मों की पहचान की गई है (जेबाली, एट अल नेचर, 2012, कार्बिली एट अल, जीन एंड डेवलपमेंट, 2011) इन छिपे हुए ट्रांसक्रिप्टोम की खोज ने कोडिंग और नॉनकोडिंग आरएनए को अलग करने की आवश्यकता को फिर से जीवंत कर दिया है। . हालाँकि, अधिकांश पिछली कोडिंग संभावित भविष्यवाणी विधियाँ संरेखण पर बहुत अधिक निर्भर करती हैं, या तो प्रोटीन साक्ष्य की खोज के लिए जोड़ीदार संरेखण या फ़ाइलोजेनेटिक संरक्षण स्कोर (जैसे सीपीसी, फ़ाइलोसीएसएफ और आरएनएकोड) की गणना करने के लिए एकाधिक संरेखण। ऐसा इसलिए है क्योंकि प्रोटीन कोडिंग आरएनए और लघु, हाउसकीपिंग/नियामक आरएनए जैसे एसएनआरएनए, एसएनओआरएनए और टीआरएनए सहित पहले से पहचाने गए अधिकांश प्रतिलेख अत्यधिक संरक्षित हैं। हालाँकि ये दृष्टिकोण अभी भी बहुत उपयोगी हैं, फिर भी इनकी कई सीमाएँ हैं:अधिकांश एलएनसीआरएनए कम संरक्षित होते हैं और वंश विशिष्ट होते हैं जो संरेखण-आधारित तरीकों की भेदभाव शक्ति को काफी सीमित कर देते हैं। उदाहरण के लिए, जेब्राफिश से पाए गए 550 एलएनसीआरएनए में से केवल 29 में ही पता लगाने योग्य अनुक्रम था
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
वेब-आधारित, कमांड-लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
अजगर
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/rna-cpat/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।