यह PTESFinder नाम का Linux ऐप है जिसकी नवीनतम रिलीज़ को ptesfinder_v1.tar.gz के रूप में डाउनलोड किया जा सकता है। इसे वर्कस्टेशन के लिए मुफ्त होस्टिंग प्रदाता ऑनवर्क्स में ऑनलाइन चलाया जा सकता है।
PTESFinder नाम के इस ऐप को OnWorks के साथ मुफ्त में ऑनलाइन डाउनलोड करें और चलाएं।
इस ऐप को चलाने के लिए इन निर्देशों का पालन करें:
- 1. इस एप्लिकेशन को अपने पीसी में डाउनलोड करें।
- 2. हमारे फ़ाइल प्रबंधक में https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस उपयोगकर्ता नाम के साथ दर्ज करें जो आप चाहते हैं।
- 3. इस एप्लिकेशन को ऐसे फाइल मैनेजर में अपलोड करें।
- 4. इस वेबसाइट से ऑनवर्क्स लिनक्स ऑनलाइन या विंडोज ऑनलाइन एमुलेटर या मैकोज़ ऑनलाइन एमुलेटर शुरू करें।
- 5. ऑनवर्क्स लिनक्स ओएस से आपने अभी शुरुआत की है, हमारे फाइल मैनेजर को https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX उस यूजरनेम के साथ जाएं जो आप चाहते हैं।
- 6. एप्लिकेशन डाउनलोड करें, इसे इंस्टॉल करें और इसे चलाएं।
पीटीईएसफाइंडर
विवरण:
PTESFinder उच्च-थ्रूपुट RNAseq डेटा से पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शनल एक्सॉन शफ़लिंग घटनाओं की पहचान करने के लिए एक कम्प्यूटेशनल पाइपलाइन है। PTESFinder स्थापित RNASeq उपकरणों की शक्ति का लाभ उठाता है और विशेष रूप से इन झूठी सकारात्मकताओं को लक्षित करने के लिए डिज़ाइन किए गए कड़े फ़िल्टर लागू करके झूठी सकारात्मक संरचनाओं के सभी ज्ञात वर्गों को व्यवस्थित रूप से बाहर कर देता है। PTESFinder जीनोमिक क्षेत्रों और कैनोनिक रूप से स्प्लिस्ड ट्रांसक्रिप्ट में मैप किए जाने पर समान रीड्स के गुणों के साथ अनुमानित पीटीईएस संरचनाओं के साथ रीड मैपिंग के संरेखण गुणों की तुलना करता है। यह दृष्टिकोण पीटीईएस समर्थित पठन में विश्वास बढ़ाता है। टेम्प्लेट-स्विचिंग घटनाओं से निकलने वाली रीड्स को अक्सर ट्रांस्क्रिप्टोम के साथ संरेखित करने पर बड़े इंडेल्स की विशेषता होती है। पीटीईएसफाइंडर पीटीईएस एक्सॉन-एक्सॉन जंक्शनों के आसपास अस्पष्ट संरेखण के साथ रीड्स को बाहर करने के लिए अतिरिक्त फिल्टर का उपयोग करता है, जिससे इन सहायक रीड्स में विश्वास और बढ़ जाता है। पीटीईएसफाइंडर उच्च विशिष्टता बनाए रखते हुए अन्य प्रकाशित तरीकों की तुलना में अधिक पीटीईएस संरचनाओं की पहचान करता है।
दर्शक
विज्ञान/अनुसंधान
यूजर इंटरफेस
कमांड लाइन
प्रोग्रामिंग भाषा
यूनिक्स शैल, जावा
श्रेणियाँ
यह एक एप्लिकेशन है जिसे https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/ से भी प्राप्त किया जा सकता है। हमारे निःशुल्क ऑपरेटिव सिस्टमों में से एक से सबसे आसान तरीके से ऑनलाइन चलाने के लिए इसे ऑनवर्क्स में होस्ट किया गया है।