Ini adalah perintah bp_run_protdist.plp yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
run_neighbor - jalankan program 'protdist' Phylip melalui Bioperl
RINGKASAN
run_protdist [-i file masukan] [-o nama file keluar]
DESKRIPSI
Berikan file penyelarasan untuk menjalankan protdist. File harus diberi nama .aln atau .phy.
Ini diperlukan agar kita dapat menentukan apakah kita perlu mengubah keselarasan cluster menjadi
philip. Anda dipersilakan untuk memperluas skrip untuk bekerja pada format MSA lain yang bioperl
mendukung. Ini dimaksudkan untuk digunakan dalam pipa manual yang sangat sederhana.
File input harus diberi nama dalam bentuk file.phy atau file.aln program mengharapkan a
file dalam bentuk (\S+)\.(\S+).
Ini akan menjalankan aplikasi 'protdist' menggunakan rumus 'KIMURA' untuk membangun protein
matriks jarak. Mereka yang memiliki phylip3.6 akan ingin membuat beberapa perubahan jika mereka ingin menggunakan
JTT. Saya senang membantu menambahkan ini sebagai argumen baris cmd jika diminta.
Gunakan bp_run_protdist.plp online menggunakan layanan onworks.net