cluster3 - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

cluster3 — Eisen-clustering data microarray

RINGKASAN

cluster3 [-f nama file] [-l 0|1] [-u nama Pekerjaan] [-g [0]] [-e [0]] [-m [msca]] [-k
nomor] [-s 0|1] [-x nomor] [-y nomor]

PILIHAN

-h--tolong Tampilkan ringkasan opsi.

-f nama file
penyimpanan file

-u nama Pekerjaan
Memungkinkan Anda untuk menentukan nama yang berbeda untuk file output (default diturunkan
dari nama file masukan)

-l 0 | 1 Menentukan apakah akan mengubah log data (default adalah 0, tidak ada log-transform)

-k jumlah Menentukan apakah akan menjalankan pengelompokan k-means alih-alih pengelompokan hierarkis,
dan jumlah cluster k yang akan digunakan (default: 0)

-x jumlah Menentukan dimensi horizontal kisi SOM (default: 2)

-y jumlah Menentukan dimensi vertikal kisi SOM (default: 1)

-s 0 | 1 Menentukan apakah akan menghitung SOM alih-alih pengelompokan hierarkis
(bawaan: 0)

-v --Versi: kapan
Tampilkan versi program.

-g [0..9] Menentukan ukuran jarak untuk pengelompokan gen 0: Tidak ada pengelompokan gen 1:
Korelasi tidak terpusat 2: Korelasi Pearson 3: Korelasi tidak terpusat, nilai absolut 4:
Korelasi Pearson, nilai absolut 5: korelasi peringkat Spearman 6: Kendall's tau 7:
Jarak Euclidean 8: Jumlah harmonik Jarak Euclidean 9: Jarak blok kota
(bawaan: 1)

-e [0..9] Menentukan ukuran jarak untuk microarray clustering 0: No clustering 1:
Korelasi tidak terpusat 2: Korelasi Pearson 3: Korelasi tidak terpusat, nilai absolut 4:
Korelasi Pearson, nilai absolut 5: korelasi peringkat Spearman 6: Kendall's tau 7:
Jarak Euclidean 8: Jumlah harmonik Jarak Euclidean 9: Jarak blok kota
(bawaan: 0)

-m [msca] Menentukan metode pengelompokan hierarkis mana yang akan digunakan m: Pairwise complete-
linkage s: Tautan tunggal berpasangan c: Tautan pusat-pusat berpasangan a: Rata-rata berpasangan-
tautan (default: m)

Gunakan cluster3 online menggunakan layanan onworks.net