Ini adalah perintah fa2dna yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
fa2dna - format database fasta untuk digunakan dengan ANFO
RINGKASAN
fa2dna [ Option | fillet ... ]
DESKRIPSI
fa2dna membaca satu atau lebih file dalam format fasta dan memformatnya kembali ke dalam database yang sesuai
untuk informasi(1). File input dapat berisi lebih dari satu urutan, dan setiap urutan dapat
dipecah menjadi beberapa contigs oleh bentangan Ns. Semua kode ambiguitas IUPAC adalah
didukung penuh.
PILIHAN
-V, --versi
Cetak nomor versi dan keluar.
-o file, --file keluaran
Tulis keluaran ke fillet.fillet harus berakhir di .dna, Karena informasi dan beberapa hilir
alat mungkin tersandung pada ekstensi yang berbeda. Defaultnya adalah nama genom dengan
itu .dna perpanjangan.
-m N, --maks N
Menetapkan jumlah maksimum Ns untuk ditafsirkan sebagai kode ambiguitas IUPAC untuk N; setiap
peregangan yang lebih panjang ditafsirkan sebagai memisahkan contigs. Standarnya adalah 2.
-g nama, --nama genom
Setel nama genom menjadi nama. Nama ini disimpan dalam file output dan akan menjadi
digunakan oleh informasi untuk mengidentifikasi genom yang cocok dalam outputnya. Genom harus a
awalan nama file keluaran untuk memungkinkan alat hilir menemukannya. Nama
harus pendek, tapi unik, seperti "hg18" atau "pt2" untuk manusia atau simpanse
genom akan bekerja dengan baik.
-d teks, --teks deskripsi
Menambahkan teks sebagai deskripsi metadata. Ini murni informasi.
-v, --bertele-tele
Menyebabkan indikator kemajuan dicetak.
Gunakan fa2dna online menggunakan layanan onworks.net