Ini adalah perintah garniere yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
garnier - Memprediksi struktur sekunder protein menggunakan metode GOR
RINGKASAN
Garasi -urutan seqall -idc bilangan bulat -file keluar melaporkan
Garasi -bantu
DESKRIPSI
Garasi adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari grup perintah "Protein:2D Structure".
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan seqall
Advanced bagian
-idc bilangan bulat
Dalam makalah mereka, GOR menyebutkan bahwa jika Anda mengetahui sesuatu tentang struktur sekunder
kandungan protein yang Anda analisis, Anda dapat melakukan prediksi dengan lebih baik. 'idc' adalah
indeks ke dalam satu set array, dharr[] dan dsarr[], yang menyediakan 'konstanta keputusan'
(dch, dcs), yang merupakan offset yang diterapkan pada bobot heliks dan lembar
(memperpanjang) istilah. Jadi, idc=0 mengatakan jangan gunakan offset konstan keputusan, dan idc=1 hingga 6
menunjukkan bahwa berbagai kombinasi dch, dcs offset harus digunakan.
Keluaran bagian
-file keluar melaporkan
Gunakan garniere online menggunakan layanan onworks.net