Ini adalah perintah HPCmapper yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
HPCmapper - buat skrip untuk memetakan bacaan
RINGKASAN
Pemeta HPC [-vb] [-kint(20)] [-wint(6)] [-hint(50)] [-tint] [-Mint]
[-eganda (.85)][-lint(1000)] [-sint(100)] [-Hint] [-mjalur]+ [-dalint(4)] [-derajatint(25)]
ref: db|bendungan dibaca:db|dam [pertama: ke[-terakhir: ke dalam]]
DESKRIPSI
Pemeta HPC menulis skrip shell UNIX ke output standar yang terdiri dari urutan
perintah yang secara efektif "memetakan" setiap pembacaan di DB membaca terhadap satu set referensi
urutan dalam DB ref, merekam semua keberpihakan lokal yang ditemukan dalam urutan file
ref.reads.1.las, ref.reads.2.las, dan seterusnya, dimana ref.reads.k.las berisi keselarasan
antara semua ref dan blok ke-k dari membaca. Parameternya persis sama dengan
untuk penyelarasan HPC(1) simpan bahwa -k, -h, dan -e default diatur dengan tepat untuk
pemetaan, dan -A dan -I pilihan tidak masuk akal karena ref dan membaca diharapkan menjadi
kumpulan data yang berbeda.
Jika bilangan bulat pertama dan terakhir hilang, maka skrip yang dihasilkan adalah untuk setiap blok di
data membaca. Jika pertama hadir maka Pemeta HPC menghasilkan skrip yang membandingkan
blok pertama melalui terakhir (terakhir = pertama jika tidak ada) terhadap DAM ref.
Gunakan HPCmapper online menggunakan layanan onworks.net