Ini adalah perintah indigo-deco yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa workstation online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
indigo-deco - deteksi perancah molekul dan dekonvolusi grup-R
RINGKASAN
nila-deco arsip [parameter]
nila-deco -h
DESKRIPSI
nila-deco melakukan deteksi perancah molekul dan dekonvolusi grup-R. Diterima
format adalah: Molfile, SDFile, RDFile, SMILES dan CML.
PILIHAN
nila-deco menerima parameter berikut.
-h Cetak pesan bantuan
-a Hitung perkiraan perancah (default tepat)
-s
Tulis perancah maksimum yang ditemukan ke molfile
-S
Tulis semua perancah yang ditemukan ke file SD
-l
Jangan menghitung perancah, tetapi muat dari file
-sr
Tulis perancah dengan situs-R ke file
-o
Tulis molekul yang disorot ke file
-r
Tulis molekul yang dihasilkan dengan r-grup terpisah ke file
dibuat Tidak ada pertimbangan aromatik
-- Menandai akhir opsi
CONTOH
nila-deco *.mol -o hl.sdf -s scaf.sdf
Baca molekul dari molfiles di direktori saat ini, simpan perancah maksimum yang ditemukan
ke scaf.mol dan simpan molekul yang disorot ke hl.sdf.
nila-deco struktur.mol banyak.sdf -s scaf.mol -S allscafs.sdf -r rg.sdf
Baca satu molekul dari structure.mol dan beberapa molekul dari many.sdf, simpan
molekul dengan r-rgoup ke rg.sdf dan simpan semua scaffold yang ditemukan ke allscafs.sdf.
nila-deco *.smi -d readyscaf.mol -o hl.sdf
Baca beberapa molekul dari setiap file SMILES di direktori saat ini, baca
scaffold dari readyscaf.mol dan simpan molekul yang disorot ke hl.sdf.
Gunakan indigo-deco online menggunakan layanan onworks.net