mia-2dmyocard-icaseries - Online di Cloud

PROGRAM:

NAMA

mia-2dmyocard-icaseries - Jalankan analisis ICA pada serangkaian gambar 2D

RINGKASAN

mia-2dmyocard-icaseries -i [pilihan]

DESKRIPSI

mia-2dmyocard-icaseries Program ini digunakan untuk menjalankan ICA pada rangkaian miokard
gambar perfusi yang diberikan dalam set segmentasi untuk membuat referensi sintetis yang
dapat digunakan untuk koreksi gerak dengan registrasi gambar. Jika tujuannya adalah untuk berlari penuh
kompensasi gerak maka lebih baik jalankan mia-2dmyoica-nonrigid, karena program ini
dasarnya sama tanpa bit pendaftaran.

PILIHAN

File-IO
-i --in-file=(masukan, diperlukan); rangkaian
masukan kumpulan data perfusi

-r --referensi=(keluaran); rangkaian
Basis nama file untuk gambar referensi. Jenis gambar dan skema penomoran adalah
diambil dari gambar masukan.

-c --save-cropped=(keluaran); rangkaian
simpan set yang dipotong dari set asli ke file ini, file gambar akan digunakan
batang nama sebagai basis nama file

--save-feature=(keluaran); rangkaian
simpan gambar fitur yang dihasilkan dari ICA dan beberapa gambar perantara
digunakan untuk segmentasi RV-LV dengan basis nama file yang diberikan ke file PNG.
Juga simpan koefisien pencampuran IC terbaik awal dan akhir
matriks.

Bantuan & Info
-V --verbose=peringatan
verbositas output, pesan cetak dari tingkat tertentu dan prioritas yang lebih tinggi.
Prioritas yang didukung mulai dari level terendah adalah:
Info - Pesan tingkat rendah
jejak - Jejak panggilan fungsi
gagal - Laporkan kegagalan pengujian
peringatan - Peringatan
kesalahan - Laporkan kesalahan
men-debug - Keluaran debug
pesan - Pesan biasa
fatal - Laporkan hanya kesalahan fatal

--hak cipta
cetak informasi hak cipta

-h --bantuan
cetak bantuan ini

-? --penggunaan
cetak bantuan singkat

--Versi: kapan
cetak nomor versi dan keluar

ICA
-C --komponen=0
Komponen ICA 0 = estimasi otomatis Komponen ICA 0 = otomatis
perkiraan

--normalisasi
IC yang dinormalisasi

--tanpa-meanstrip
jangan lepaskan rata-rata dari kurva pencampuran

-s --segscale=1.4
segmen dan skala kotak tanaman di sekitar segmen LV (0=tidak ada segmentasi) dan
skala kotak tanaman di sekitar LV (0=tidak ada segmentasi)

-k --lewati=0
lewati gambar di awal seri seperti gambar lainnya
modalitiesmelewati gambar di awal seri seperti gambar lainnya
modalitas

-m --max-ica-iter=400
jumlah maksimum iterasi di ICAjumlah maksimum iterasi di ICA

-E --segmethod=fitur
Metode segmentasi
delta-puncak - perbedaan gambar peningkatan puncak
fitur - gambar fitur
delta-fitur - perbedaan gambar fitur

Pengolahan
--utas=-1
Jumlah maksimum utas yang digunakan untuk pemrosesan, Jumlah ini harus lebih rendah
atau sama dengan jumlah inti prosesor logis dalam mesin. (-1:
estimasi otomatis). Jumlah utas maksimum yang digunakan untuk pemrosesan, Ini
nomor harus lebih rendah atau sama dengan jumlah inti prosesor logis di
mesin. (-1: estimasi otomatis).

CONTOH

Evaluasi referensi sintetis dari set segment.set dan simpan ke refXXXX.??? oleh
menggunakan lima komponen independen, dan melewatkan 2 gambar. Per default kotak pembatas
di sekitar LV akan disegmentasi dan diskalakan sebesar 1.4 dan gambar yang dipotong akan disimpan ke
cropXXXX.??? dan set segmentasi cropped.set dibuat. Jenis file gambar ??? adalah
dikurangkan dari gambar input di segment.set.

mia-2dmyocard-icaseries -i segment.set -r ref -o ref -k 2 -C 5

PENULIS

Gert Wolny

HAK CIPTA

Perangkat lunak ini adalah Hak Cipta (c) 1999-2015 Leipzig, Jerman dan Madrid, Spanyol. Itu datang
dengan BENAR-BENAR TANPA JAMINAN dan Anda dapat mendistribusikannya kembali di bawah ketentuan GNU
LISENSI UMUM UMUM Versi 3 (atau lebih baru). Untuk informasi lebih lanjut, jalankan program dengan
opsi '--hak cipta'.

Gunakan mia-2dmyocard-icaseries online menggunakan layanan onworks.net