This is the Linux app named clusterProfiler whose latest release can be downloaded as clusterProfilersourcecode.tar.gz. It can be run online in the free hosting provider OnWorks for workstations.
Unduh dan jalankan aplikasi ini secara online bernama clusterProfiler dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
SCREENSHOT:
ClusterProfiler
DESKRIPSI:
ClusterProfiler adalah paket R/Bioconductor yang menyediakan alur kerja terpadu untuk analisis pengayaan fungsional guna menginterpretasikan hasil omik berthroughput tinggi. Paket ini mendukung analisis representasi berlebih dan analisis pengayaan set gen, sehingga Anda dapat bekerja dengan daftar gen yang tidak diperingkat atau statistik yang diperingkat dari jalur diferensial. Paket ini terhubung ke berbagai basis pengetahuan—seperti Gene Ontology, KEGG, Reactome, Disease Ontology, MeSH, dan lainnya—melalui antarmuka yang konsisten sehingga Anda dapat mengkueri berbagai lensa biologis tanpa menulis ulang kode. Paket ini dirancang untuk cakupan yang luas, mencakup fitur pengkodean dan non-pengkodean serta ribuan organisme dengan memanfaatkan anotasi yang terus diperbarui. Hasil dikembalikan dalam struktur yang rapi dan mudah dimanipulasi, serta berpasangan secara alami dengan fungsi visualisasi yang kaya (melalui perangkat pendamping) untuk meringkas jalur, istilah, dan hubungan set gen.
Fitur
- Alur kerja ORA dan GSEA terpadu di berbagai sumber anotasi
- Dukungan spesies yang luas menggunakan anotasi gen terkini
- Output rapi yang terintegrasi dengan bersih dengan jalur data R hilir
- Visualisasi bawaan hasil pengayaan melalui alat plot pendamping
- Utilitas perbandingan multi-grup (misalnya, compareCluster) untuk analisis lintas kondisi
- Sketsa dan manual terperinci untuk studi pengayaan yang dapat direproduksi dan menyeluruh
Bahasa Pemrograman
R
KATEGORI
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diunduh dari https://sourceforge.net/projects/clusterprofiler.mirror/. Aplikasi ini dihosting di OnWorks agar dapat dijalankan secara daring dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.