Ini adalah aplikasi Linux bernama PTESFinder yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai ptesfinder_v1.tar.gz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama PTESFinder ini dengan OnWorks secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Pencari PTES
DESKRIPSI:
PTESFinder adalah saluran komputasi untuk mengidentifikasi peristiwa Pengacakan Exon Pasca-transkripsi dari data RNAseq throughput tinggi. PTESFinder memanfaatkan kekuatan alat RNASeq yang sudah mapan dan secara sistematis mengecualikan semua kelas struktur positif palsu yang diketahui dengan menerapkan filter ketat yang dirancang untuk secara khusus menargetkan positif palsu ini. PTESFinder membandingkan kualitas penyelarasan pemetaan pembacaan dengan struktur PTES diduga dengan kualitas pembacaan yang sama ketika dipetakan ke wilayah genomik dan transkrip yang disambungkan secara kanonik. Pendekatan ini meningkatkan kepercayaan pada pembacaan yang mendukung PTES. Bacaan yang berasal dari peristiwa peralihan templat sering kali ditandai dengan indel besar saat disejajarkan dengan transkriptom. PTESFinder menggunakan filter tambahan untuk mengecualikan pembacaan dengan keberpihakan ambigu di sekitar persimpangan ekson-ekson PTES, yang semakin meningkatkan kepercayaan pada pembacaan pendukung ini. PTESFinder mengidentifikasi lebih banyak struktur PTES daripada metode lain yang diterbitkan sambil mempertahankan spesifisitas yang tinggi.
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
Unix Shell, Jawa
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/ptesfinder-v1/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.