Ini adalah aplikasi Linux bernama SplitMEM yang rilis terbarunya dapat diunduh sebagai splitmem.1.0.tgz. Ini dapat dijalankan secara online di penyedia hosting gratis OnWorks untuk workstation.
Unduh dan jalankan secara online aplikasi bernama SplitMEM dengan OnWorks ini secara gratis.
Ikuti petunjuk ini untuk menjalankan aplikasi ini:
- 1. Download aplikasi ini di PC Anda.
- 2. Masuk ke file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan username yang anda inginkan.
- 3. Upload aplikasi ini di filemanager tersebut.
- 4. Jalankan emulator online OnWorks Linux atau Windows online atau emulator online MACOS dari situs web ini.
- 5. Dari OS Linux OnWorks yang baru saja Anda mulai, buka file manager kami https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dengan nama pengguna yang Anda inginkan.
- 6. Download aplikasinya, install dan jalankan.
Pisahkan MEM
DESKRIPSI:
Dengan munculnya teknologi sekuensing yang ditingkatkan, genomik berkembang dari satu referensi per spesies paradigma menjadi pendekatan pan-genom yang lebih komprehensif dengan banyak individu diwakili dan dianalisis bersama. Di sini kami memperkenalkan algoritma waktu dan ruang O(n log n) baru yang disebut splitMEM, yang secara langsung membangun grafik de Bruijn terkompresi untuk genom pan dengan panjang total n. Untuk mencapai kompleksitas waktu ini, kami menambahkan pohon suffix dengan suffix skips, sebuah konstruksi baru yang memungkinkan kami untuk melintasi beberapa tautan suffix dalam waktu yang konstan, dan menggunakannya untuk menguraikan secara efisien pencocokan tepat maksimal (MEMs) selama traversal pohon suffix.
Para penonton
Sains/Penelitian
User interface
Garis komando
Bahasa Pemrograman
C + +
Kategori
Ini adalah aplikasi yang juga dapat diambil dari https://sourceforge.net/projects/splitmem/. Ini telah di-host di OnWorks untuk dijalankan secara online dengan cara termudah dari salah satu Sistem Operasi gratis kami.