Questo è il comando fastaq-to_fasta che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
fastaq_to_fasta - Converte una varietà di formati di input in un formato FASTA ben formattato
DESCRIZIONE
utilizzo: fastaq_to_fasta [opzioni]
Converte una varietà di formati di input in un formato FASTA ben formattato
posizionale argomenti:
infile Nome del file di input. Può essere uno qualsiasi di FASTA, FASTQ, GFF3, EMBL, GBK, Phylip
file di uscita
Nome del file di output
opzionale argomenti:
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
-l LUNGHEZZA_LINEA, --lunghezza_linea LUNGHEZZA_LINEA
Numero di basi su ogni riga di sequenza del file di output. Imposta a zero per no
interruzioni di riga in sequenze [60]
-s, --striscia_dopo_spazio bianco
Rimuovi tutto dopo il primo spazio bianco in ogni nome di sequenza
-u, --check_unico
Muori se uno qualsiasi dei nomi della sequenza di output non è univoco
Usa fastaq-to_fasta online utilizzando i servizi onworks.net