Questo è il comando garniere che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
garnier - Predice la struttura secondaria delle proteine usando il metodo GOR
SINOSSI
guarnire -sequenza seguito -idc numero intero -file di uscita rapporto
guarnire -Aiuto
DESCRIZIONE
guarnire è un programma a riga di comando di EMBOSS ("the European Molecular Biology Open
Suite Software”). Fa parte dei gruppi di comandi "Proteina:Struttura 2D".
VERSIONI
Ingresso pagina
-sequenza seguito
Filtri pagina
-idc numero intero
Nel loro articolo, GOR menziona che se sai qualcosa sulla struttura secondaria
contenuto della proteina che stai analizzando, puoi fare meglio nella previsione. 'idc' è an
index in un insieme di array, dharr[] e dsarr[], che forniscono 'costanti di decisione'
(dch, dcs), che sono offset applicati ai pesi per l'elica e il foglio
(estendere) i termini. Quindi, idc=0 dice di non usare gli offset della costante di decisione e idc=1 a 6
indica che devono essere utilizzate varie combinazioni di offset dch,dcs.
Uscita pagina
-file di uscita rapporto
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