Questo è il comando khmer che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
khmer - conteggio k-mer, filtraggio e attraversamento grafico FTW!
khmer è una libreria e un toolkit per eseguire analisi e trasformazioni di set di dati basati su k-mer
SINOSSI
khmer [opzioni] args
per esempio.
khmer carico in conteggio -x 1e8 -k 20 legge.ct legge.fa.gz
USO
Questa manpage descrive solo il khmer script di involucro. Per conoscere il software e
come usarlo per favore vedi /usr/share/doc/khmer o altro http://khmer.readthedocs.org/.
Su Debian/Ubuntu, i manutentori dei pacchetti evitano di inserire direttamente grandi raccolte di script
nel PERCORSO di sistema. Piuttosto, viene utilizzato un singolo script wrapper per avviare lo script che tu
vuoi usare; quindi se le istruzioni khmer dicono di correre load-in-counting.py
...qualunque cosa... devi anteporre questo comando con khmer. Inoltre, l'estensione .py
può essere omesso, risultando in un comando del formato mostrato sopra.
Se non ti piace, aggiungi semplicemente /usr/lib/khmer/bin al tuo PERCORSO personale.
Usa khmer online utilizzando i servizi onworks.net