Questo è il comando maskAlignedReads che può essere eseguito nel provider di hosting gratuito OnWorks utilizzando una delle nostre molteplici workstation online gratuite come Ubuntu Online, Fedora Online, emulatore online Windows o emulatore online MAC OS
PROGRAMMA:
NOME
maskAlignedReads.py - Lettura allineata con maschera nel file delle regioni
DESCRIZIONE
utilizzo: maskAlignedReads.py [-h] [-v] [-l LOGFILE] [-d] [-i]
inCmpFile inRgnFofn outRgnFofn
Usa in.cmp.h5 per mascherare le regioni corrispondenti dei file in in.rgn.h5, scrivi l'output in un nuovo
rgn.ffn.
posizionale argomenti:
inCmpFile
Un file cmp.h5 di input.
inRgnFofn
Una serie di file della tabella della regione di input.
outRgnFofn
Una serie di file della tabella della regione di output.
opzionale argomenti:
-h, --Aiuto
mostra questo messaggio di aiuto ed esci
-v, --versione
mostra il numero di versione del programma ed esci
-l FILE DI REGISTRO, --logFile FILE DI LOG
Specificare un file a cui accedere. Il valore predefinito è stderr. (predefinito: Nessuno)
-d, - debug
Aumenta la verbosità della registrazione (impostazione predefinita: False)
-i, --Informazioni
Visualizza le voci del registro informativo (impostazione predefinita: False)
Usa maskAlignedReads online utilizzando i servizi onworks.net