mia-2dmyocard-icaseries - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mia-2dmyocard-icaseries - Esegui un'analisi ICA su una serie di immagini 2D

SINOSSI

mia-2dmyocard-icaseries -i [opzioni]

DESCRIZIONE

mia-2dmyocard-icaseries Questo programma viene utilizzato per eseguire un ICA su una serie di miocardio
immagini di perfusione fornite in un insieme di segmentazione per creare riferimenti sintetici che
può essere utilizzato per la correzione del movimento mediante la registrazione dell'immagine. Se l'obiettivo è quello di eseguire un pieno
compensazione del movimento, allora è meglio eseguire mia-2dmyoica-nonrigid, poiché questo programma è
essenzialmente lo stesso senza i bit di registrazione.

VERSIONI

File-IO
-i --in-file=(input, richiesto); corda
inserire il set di dati di perfusione

-r --references=(output); corda
Base del nome del file per le immagini di riferimento. Il tipo di immagine e lo schema di numerazione sono
prelevato dalle immagini in ingresso.

-c --save-cropped=(output); corda
salva il set ritagliato del set originale in questo file, verranno utilizzati i file di immagine
la radice del nome come base del nome del file

--save-feature=(output); corda
salvare le immagini delle caratteristiche risultanti dall'ICA e alcune immagini intermedie
utilizzato per la segmentazione RV-LV con il nome file dato in base ai file PNG.
Salva anche i coefficienti del migliore iniziale e della miscelazione IC finale
matrice.

Aiuto & Info
-V --verbose=avvertimento
verbosità dell'output, stampa messaggi di un dato livello e priorità più alte.
Le priorità supportate a partire dal livello più basso sono:
info ‐ Messaggi di basso livello
tracciare ‐ Traccia chiamata funzione
fallire ‐ Segnalare i fallimenti dei test
identificazione dei warning ‐ Avvertenze
errore ‐ Segnala errori
mettere a punto ‐ Uscita di debug
messaggio ‐ Messaggi normali
fatale ‐ Segnala solo errori fatali

--diritto d'autore
stampa le informazioni sul copyright

-h --aiuto
stampa questo aiuto

-? --uso
stampa un breve aiuto

--versione
stampa il numero di versione ed esci

ICA
-C --componenti=0
Componenti ICA 0 = stima automatica Componenti ICA 0 = automatico
stima

--normalizzare
CI normalizzati

--non-strip
non togliere la media dalle curve di miscelazione

-s --segscale=1.4
segmentare e ridimensionare il riquadro di ritaglio attorno al segmento LV (0=nessuna segmentazione) e
ridimensiona la casella di ritaglio attorno al LV (0=nessuna segmentazione)

-k --salta=0
salta le immagini all'inizio della serie come sono di altre
modalitàsalta le immagini all'inizio della serie in quanto sono di altre
modalità

-m --max-ica-iter=400
numero massimo di iterazioni in ICAnumero massimo di iterazioni in ICA

-E --segmethod=caratteristiche
Metodo di segmentazione
delta-picco ‐ differenza delle immagini di miglioramento del picco
Caratteristiche ‐ immagini in primo piano
caratteristica delta ‐ differenza delle immagini caratteristiche

Processando
--thread=-1
Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione, questo numero dovrebbe essere inferiore
o uguale al numero di core del processore logico nella macchina. (-1:
stima automatica).Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione,Questo
il numero deve essere inferiore o uguale al numero di core del processore logico in
la macchina. (-1: stima automatica).

ESEMPIO

Valuta i riferimenti sintetici da set segment.set e salvali in refXXXX.??? di
utilizzando cinque componenti indipendenti e saltando 2 immagini. Per impostazione predefinita un riquadro di delimitazione
intorno al LV verrà segmentato e ridimensionato di 1.4 e le immagini ritagliate verranno salvate in
raccoltoXXXX.??? e viene creato un set di segmentazione cropped.set. Il tipo di file immagine ??? è
detratto dalle immagini di input in segment.set.

mia-2dmyocard-icaseries -i segmento.set -r ref -o ref -k 2 -C 5

AUTORE(i)

Gert Wollny

COPYRIGHT

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con ASSOLUTAMENTE NESSUNA GARANZIA e puoi ridistribuirlo secondo i termini della GNU
LICENZA PUBBLICA GENERALE Versione 3 (o successiva). Per maggiori informazioni eseguire il programma con il
opzione '--copyright'.

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