mia-3dfluid - Online nel cloud

PROGRAMMA:

NOME

mia-3dfluid - Registrazione fluidodinamica 3D

SINOSSI

mia-3dfluido -i -r -o [opzioni]

DESCRIZIONE

mia-3dfluido Questo programma viene utilizzato per la registrazione non rigida basata sulla fluidodinamica come
descritto in: Wollny, G. e Kruggel, F., "Costo computazionale della registrazione non rigida
algoritmi basati sulla fluidodinamica', IEEE Transactions on Medical Imaging, 11(8), pagg.
946-952, 2002, doi:10.1109/TMI.2002.803113. Utilizza SSD come unica registrazione
criterio.

VERSIONI

File-IO
-i --in-image=(input, richiesto); io
input image Per i tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dimage/io

-r --ref-image=(input, richiesto); io
immagine di riferimento Per i tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dimage/io

-o --out-transformation=(output, richiesto); io
trasformazione dell'output che comprende il campo di trasformazione della registrazione Per
tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dtransform/io

-d --out-immagine=(output); io
salva immagine deformata Per i tipi di file supportati vedere PLUGINS:3dimage/io

Aiuto & Info
-V --verbose=avvertimento
verbosità dell'output, stampa messaggi di un dato livello e priorità più alte.
Le priorità supportate a partire dal livello più basso sono:
info ‐ Messaggi di basso livello
tracciare ‐ Traccia chiamata funzione
fallire ‐ Segnalare i fallimenti dei test
identificazione dei warning ‐ Avvertenze
errore ‐ Segnala errori
mettere a punto ‐ Uscita di debug
messaggio ‐ Messaggi normali
fatale ‐ Segnala solo errori fatali

--diritto d'autore
stampa le informazioni sul copyright

-h --aiuto
stampa questo aiuto

-? --uso
stampa un breve aiuto

--versione
stampa il numero di versione ed esci

Processando
--thread=-1
Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione, questo numero dovrebbe essere inferiore
o uguale al numero di core del processore logico nella macchina. (-1:
stima automatica).Numero massimo di thread da utilizzare per l'elaborazione,Questo
il numero deve essere inferiore o uguale al numero di core del processore logico in
la macchina. (-1: stima automatica).

Iscrizione parametri
--disable-multigrid
disabilitare l'elaborazione multi-griglia

--disable-fullres
disabilitare l'elaborazione sull'immagine a piena risoluzione

--lambda=1
costante di elasticitàcostante di elasticità

--mu=1
costante di elasticitàcostante di elasticità

-s --dimensione-inizio=16
dimensione multigrid inizialedimensione multigrid iniziale

-m --metodo=sora
metodo per risolvere PDE
sor ‐ successivo iperrilassamento
sora ‐ Il rilassamento di Gauss Southwell

--passo=0.8
Dimensione del passo iniziale Dimensione del passo iniziale

-p --interpolatore=bspline:d=3
image interpolator kernelimage interpolator kernel Per i plugin supportati
vedi PLUGIN:1d/splinekernel

--rilassati=1
fattore di iperrilassamento vor metodo sorfattore di iperrilassamento vor metodo sor

--maxiter=10
iterazioni massime iterazioni massime

--epsilon=0.01
condizione di troncamentocondizione di troncamento

--materia=4
intensità al di sopra della quale si assume la materia reale intensità (sperimentale) al di sopra
quale materia reale si assume (sperimentale)

PLUGIN: 1d/splinekernel

bspline Creazione del kernel B-spline, i parametri supportati sono:

d = 3; intero in [0, 5]
Grado spline.

mamme Creazione del kernel OMoms-spline, i parametri supportati sono:

d = 3; intero in [3, 3]
Grado spline.

PLUGIN: immagine 3d/io

analizzare Analizza immagine 7.5

Estensioni file riconosciute: .HDR, .hdr

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno, 16 bit con segno, 32 bit con segno, 32 bit con virgola mobile,
virgola mobile 64 bit

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

dicom Serie di immagini Dicom in 3D

Estensioni file riconosciute: .DCM, .dcm

Tipi di elementi supportati:
16 bit con segno, 16 bit senza segno

hdf5 I/O immagine 5D HDF3

Estensioni file riconosciute: .H5, .h5

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, 64 bit con segno, 64 bit senza segno, flottante
punto 32 bit, virgola mobile 64 bit

inria immagine INRIA

Estensioni file riconosciute: .INR, .inr

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

mhd Immagine MetaIO 3D IO utilizzando l'implementazione VTK (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

elegante NIFTI-1 immagine 3D IO

Estensioni file riconosciute: .NII, .nii

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, 32 bit senza segno, 64 bit con segno, 64 bit senza segno, virgola mobile 32
bit, virgola mobile 64 bit

vff VFF Sun formato raster

Estensioni file riconosciute: .VFF, .vff

Tipi di elementi supportati:
8 bit senza segno, 16 bit con segno

vista vista 3D

Estensioni file riconosciute: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

VTI Immagine 3D VTK-XML in entrata e in uscita (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .VTI, .vti

Tipi di elementi supportati:
8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno, 32 . con segno
bit, unsigned 32 bit, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64 bit

vk Ingresso e uscita legacy dell'immagine 3D VTK (sperimentale).

Estensioni file riconosciute: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipi di elementi supportati:
dati binari, 8 bit con segno, 8 bit senza segno, 16 bit con segno, 16 bit senza segno,
32 bit con segno, 32 bit senza segno, virgola mobile 32 bit, virgola mobile 64
bit

PLUGIN: 3dtrasformare/io

bbs IO serializzato binario (non portatile) di trasformazioni 3D

Estensioni di file riconosciute: .bbs

pool di dati IO virtuale da e verso il pool di dati interno

Estensioni di file riconosciute: .@

vista Archiviazione Vista di trasformazioni 3D

Estensioni file riconosciute: .v, .v3dt

xml IO serializzato XML di trasformazioni 3D

Estensioni file riconosciute: .x3dt

ESEMPIO

Registra l'immagine test.v nell'immagine ref.v e scrivi il campo del vettore di deformazione regfield.v.
Avvia la registrazione alla dimensione minima superiore a 16 pixel.

mia-3dfluid -i test.v -r ref.v -o regfield.v -s 16

AUTORE(i)

Gert Wollny

COPYRIGHT

Questo software è protetto da Copyright (c) 1999‐2015 Lipsia, Germania e Madrid, Spagna. Viene
con ASSOLUTAMENTE NESSUNA GARANZIA e puoi ridistribuirlo secondo i termini della GNU
LICENZA PUBBLICA GENERALE Versione 3 (o successiva). Per maggiori informazioni eseguire il programma con il
opzione '--copyright'.

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