Questa è l'app Linux chiamata AlphaFold 3, la cui ultima versione può essere scaricata come AlphaFoldv3.0.1sourcecode.tar.gz. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app chiamata AlphaFold 3 con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
IMMAGINI:
AlphaFold3
DESCRIZIONE:
AlphaFold 3, sviluppato da Google DeepMind, è un sistema avanzato di deep learning per la previsione di strutture e interazioni biomolecolari con un'accuratezza eccezionale. Questo repository fornisce la pipeline di inferenza completa per l'esecuzione di AlphaFold 3, sebbene l'accesso ai parametri del modello sia limitato e debba essere ottenuto direttamente da Google in base a specifici termini d'uso. Il sistema è progettato per applicazioni di ricerca scientifica in biologia strutturale, biochimica e bioinformatica, consentendo una modellazione accurata di proteine, ligandi e modifiche covalenti. Gli utenti possono eseguire previsioni locali tramite container Docker, integrando il processo di inferenza di AlphaFold 3 con le configurazioni di input JSON fornite. Il software include opzioni flessibili per l'esecuzione sia della pre-elaborazione dei dati che dell'inferenza accelerata da GPU, consentendo agli utenti di adattarsi alle risorse di calcolo disponibili.
Caratteristiche
- Implementa la pipeline di inferenza completa di AlphaFold 3 per la previsione della struttura
- Supporta la pre-elaborazione dei dati basata sulla CPU e le modalità di inferenza accelerate dalla GPU
- Ambiente basato su Docker per una distribuzione e riproducibilità semplificate
- Configurazione di input basata su JSON per attività di previsione personalizzabili
- Progettato per la modellazione della struttura e dell'interazione biomolecolare
- Ampia documentazione per l'installazione, formati di input/output e problemi noti
Linguaggio di programmazione
C++, Python
Categorie
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/alphafold-3.mirror/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.