Questa è l'app Linux denominata ARDEN da eseguire in Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come ARDEN.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata ARDEN per eseguirla gratuitamente in Linux online con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avviare l'emulatore online OnWorks Linux o Windows online o l'emulatore online MACOS da questo sito Web.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Linux che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione, installala ed eseguila.
ARDEN per funzionare in Linux online
DESCRIZIONE:
Introduciamo ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data), un nuovo benchmark che stima i tassi di errore in base a letture sperimentali reali e un genoma di riferimento artificiale generato in aggiunta. Consente il calcolo dei tassi di errore specificamente per un set di dati e la costruzione di una curva ROC. In tal modo, può essere utilizzato per ottimizzare i parametri per i read mapper, per selezionare i read mapper per un problema specifico o anche per filtrare gli allineamenti in base alla stima della qualità.Interfaccia utente
Riga di comando
Linguaggio di programmazione
Python
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/arden/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.