Questa è l'app di Windows denominata kallisto la cui ultima versione può essere scaricata come kallisto_windows-v0.50.0.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app chiamata kallisto con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI:
callisto
DESCRIZIONE:
kallisto è un programma per la quantificazione quasi ottimale delle abbondanze di trascrizioni da dati RNA-Seq, o più in generale di sequenze target utilizzando letture di sequenziamento ad alto rendimento. Si basa sull'idea di utilizzare lo pseudoallineamento per determinare rapidamente le letture e la compatibilità dei target, senza necessità di allineamento.
Secondo i benchmark eseguiti su un computer desktop Mac, kallisto può quantificare 30 milioni di letture di sequenze di RNA di massa umana in meno di 3 minuti con solo le sequenze di lettura e un indice di trascrittoma, che di per sé può richiedere più di 10 minuti per essere costruito. E poiché utilizza lo pseudoallineamento, è resistente agli errori nelle letture e conserva le informazioni chiave necessarie per la quantificazione. Questo rende Kallisto non solo veloce ma anche estremamente preciso. In molti benchmark, supera di gran lunga gli strumenti esistenti.
Caratteristiche
- Usa lo pseudoallineamento
- Veloce e preciso
- Quantificato bulk RNA-Seq può essere analizzato con investigatore
- Può essere utilizzato con bustools per pre-elaborare dati RNA-seq a cella singola
Linguaggio di programmazione
C
Categorie
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/kallisto.mirror/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri Sistemi Operativi gratuiti.