Questa è l'app Windows denominata MCPerm: permutazione Monte Carlo SNP per l'esecuzione in Windows online su Linux online la cui ultima versione può essere scaricata come MCPerm_1.1.2.tar.gz. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata MCPerm: permutazione Monte Carlo SNP per l'esecuzione in Windows online su Linux online con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
MCPerm: permutazione Monte Carlo SNP per l'esecuzione in Windows online su Linux online
DESCRIZIONE:
MCPerm: un metodo di permutazione Monte Carlo per la correlazione tra test multipli nello studio di associazione caso-controlloIl test di permutazione tradizionale (TradPerm) è un importante metodo di analisi non parametrico che può essere considerato il gold standard per correzioni multiple del test nello studio di associazione caso-controllo. Tuttavia, si basa sui dati originali dei genotipi e dei fenotipi del polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) per eseguire un gran numero di rimescolamenti casuali, e quindi è computazionalmente intensivo, specialmente per lo studio di associazione a livello di genoma (GWAS). Per migliorare la velocità di calcolo senza modificare la dimensione del p-value di TradPerm, abbiamo sviluppato un metodo di permutazione Monte Carlo (MCPerm) come alternativa efficiente a TradPerm.
Metodi: MCPerm non ha bisogno di mescolare i genotipi originali e i dati sui fenotipi. Utilizza il metodo Monte Carlo, impiega la distribuzione ipergeometrica in due fasi per generare il numero casuale di genotipi (AA, Aa e aa) nei casi e nei controlli.
Linguaggio di programmazione
B / R
Questa è un'applicazione che può anche essere scaricata da https://sourceforge.net/projects/mcperm/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.