Si tratta dell'app per Windows denominata MetaPhat -meta-pheno-association-tracker, la cui ultima versione può essere scaricata come plasma_lipids_decomposed.zip. Può essere eseguita online sul provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online gratuitamente questa app denominata MetaPhat -meta-pheno-association-tracker con OnWorks.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI:
MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
DESCRIZIONE:
MetaPhat è un programma open source per rilevare i tratti ottimali del sottoinsieme di SNP principali a partire dai risultati riassuntivi di GWAS di più biomarcatori. I tratti migliori derivano dalla scomposizione sistematica delle associazioni multivariate in tratti centrali, sulla base di BIC e P-value ottimali ottenuti da modelli CCA multivariati. I risultati delle tracce SNP vengono rappresentati graficamente e raggruppati per analizzare e migliorare la specificità delle associazioni fenotipo-genotipo mv.
rilasciato con funzione LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
Avvio rapido https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
ingressi https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
Esempio di lipidi globali https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
Citazione: Lin et al. (2020) MetaPhat: Rilevamento e scomposizione di associazioni multivariate da statistiche di associazione univariate a livello del genoma. Front. Genet. doi: 10.
Caratteristiche
- analisi multivariata dei tratti del genoma
- Selezione ottimale del sottoinsieme di tratti basata sul valore p e sul BIC
- grafici di tracciamento della decomposizione dei tratti
- Aggregazione della popolazione e del blocco LD
- file riassuntivo dei tratti principali SNP e driver
- cluster di Spearman di rango del tratto snp-snp
Questa applicazione può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. È ospitata su OnWorks per poter essere eseguita online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.