Questa è l'app di Windows denominata NGSEP la cui ultima versione può essere scaricata come NGSEPwindows_4.1.0.zip. Può essere eseguito online nel provider di hosting gratuito OnWorks per workstation.
Scarica ed esegui online questa app denominata NGSEP con OnWorks gratuitamente.
Segui queste istruzioni per eseguire questa app:
- 1. Scaricata questa applicazione sul tuo PC.
- 2. Entra nel nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 3. Carica questa applicazione in tale file manager.
- 4. Avvia qualsiasi emulatore online OS OnWorks da questo sito Web, ma migliore emulatore online Windows.
- 5. Dal sistema operativo OnWorks Windows che hai appena avviato, vai al nostro file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con il nome utente che desideri.
- 6. Scarica l'applicazione e installala.
- 7. Scarica Wine dai repository software delle tue distribuzioni Linux. Una volta installato, puoi quindi fare doppio clic sull'app per eseguirli con Wine. Puoi anche provare PlayOnLinux, un'interfaccia fantasiosa su Wine che ti aiuterà a installare programmi e giochi Windows popolari.
Wine è un modo per eseguire il software Windows su Linux, ma senza Windows richiesto. Wine è un livello di compatibilità Windows open source in grado di eseguire programmi Windows direttamente su qualsiasi desktop Linux. Essenzialmente, Wine sta cercando di re-implementare abbastanza Windows da zero in modo che possa eseguire tutte quelle applicazioni Windows senza effettivamente bisogno di Windows.
IMMAGINI:
NGSEP
DESCRIZIONE:
NGSEP è un framework integrato per l'analisi dei dati di sequenziamento del DNA ad alto rendimento. L'uso principale di NGSEP è la costruzione e l'analisi a valle di grandi set di dati di variazione genomica. NGSEP esegue il rilevamento accurato e la genotipizzazione di varianti a singolo nucleotide (SNV), indel piccoli e grandi, ripetizioni in tandem brevi (STR), inversioni e varianti del numero di copie (CNV). NGSEP fornisce anche moduli per l'annotazione funzionale, il filtraggio, la conversione del formato, il confronto, il clustering, l'imputazione, l'analisi dell'introgressione e diversi tipi di statistiche. Un elenco completo delle funzionalità è disponibile nel nostro wiki (https://sourceforge.net/p/ngsep/wiki/Home/).
NEWS: Abbiamo appena reso disponibile la prima versione del nostro assemblatore di genomi de-novo. Ulteriori dettagli sono disponibili nel wiki.
Caratteristiche
- Assemblaggio de-novo dei genomi
- Allineamento delle letture grezze a un genoma di riferimento
- Rilevamento di SNP, CNV e varianti strutturali
- Manipolazione VCF: annotazione funzionale, unione, filtro, confronto, conversione di formato, imputazione
- Legge il demultiplazione
- Allineamento di assemblaggi di genomi annotati
- Statistiche e filtraggio sulle annzioni del trascrittoma in formato GFF3
Pubblico
Industria sanitaria, Scienza/ricerca, Altro pubblico, Agricoltura
Interfaccia utente
Java SWT, Console/Terminale, Eclipse
Linguaggio di programmazione
Java
Questa è un'applicazione che può essere scaricata anche da https://sourceforge.net/projects/ngsep/. È stato ospitato in OnWorks per essere eseguito online nel modo più semplice da uno dei nostri sistemi operativi gratuiti.