bowtie2-inspect - מקוון בענן

תָכְנִית:

שֵׁם

bowtie2-inspect - עטיפה לאינדקס bowtie2-inspect-*

תַקצִיר

bowtie2-inspect [אפשרויות]*

תיאור

Bowtie 2 גרסה 2.2.6 מאת Ben Langmead (langmea@cs.jhu.edu, www.cs.jhu.edu/~langmea)


שם הקובץ bt2 פחות .1.bt2/.2.bt2

כברירת מחדל, מדפיס רשומות FASTA של רצפי הנוקלאוטידים שצורפו לאינדקס לתקן
הַחוּצָה. עם -n, רק מדפיס שמות. עם -s, רק מדפיס סיכום של האינדקס
פרמטרים ורצפים. עם -e, שומר על צבעים אם ישים.

אפשרויות

--אינדקס גדול
בדיקה בכפייה של המדד 'גדול', גם אם קיים 'קטן'.

-a/--ברחבי
מספר תווים על פני פלט FASTA (ברירת מחדל: 60)

-n/--שמות
הדפס שמות של רצפי עזר בלבד

-s/--סיכום
הדפס תקציר כולל. שמות ref, אורכים, מאפייני אינדקס

-e/--bt2-ref
בנה מחדש הפניה מ-.bt2 (איטי, שומר על צבעים)

-v/--מִלוּלִי
פלט מפורט (לניפוי באגים)

-h/--עֶזרָה
להדפיס תיאור מפורט של הכלי והאפשרויות שלו

- עזרה להדפיס הודעת שימוש זו

השתמש ב-bowtie2-inspect באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net