זוהי הפקודה bp_seqpartp שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
bp_seqpart.pl - לוקח קובץ רצף אחד או יותר ומחלק אותם למספר קבצי טעינה
קבצים מאוזנים.
נוהג
bp_seqpart.pl -n [-ח, -פ , -f , -o ]
מספר הקבצים ליצירה באמצעות חלוקה למחיצות -n
-h הודעת עזרה זו
קידומת -p עבור כל שמות הקבצים של FASTA שמוצגים, הקבצים הם מהצורה / #.
פורמט -f של הקבצים, ברירת המחדל היא FASTA אך ניתן לציין כל דבר הנתמך על ידי SeqIO מ-BioPerl
-o ספריית פלט שבה יש למחוק את קבצי הרצף המפוצל
תיאור
עטיפת סקריפט SeqIO המאפשרת חלוקה של קבצי רצף מרובים לקובצי כמעט שווים
חלקים בגודל מדויק לעיבוד מקבילי מאוחר יותר. אפילו אם יש לך 10 קבצי קלט שמופקים אליהם
10 קבצים יאזנו את הקבצים כך שיכילו אורך כולל דומה של רצף. המזהים הם
מתעלמים ממנו בעת קבלת החלטה כיצד לאזן כל רצף.
השתמש ב- bp_seqpartp באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net