זוהי הפקודה fastaselect שניתן להפעיל בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
fastaselect - בחר פסטה רצפים in a פילה
תיאור
סקריפט זה בוחר רצפי fasta בקובץ לפי שמות שניתנו בקובץ שמות.
בהינתן קובץ FASTA (ואולי קובץ באיכות FASTA) וקובץ עם שמות של קריאות,
בחר את הרצפים מהקלט FASTA (וקובץ איכות) וכותב אותם לפלט
פאסטה.
אם קיים קובץ איכותי של fasta (שם בסיס זהה, אבל עם .qual מצורף), אז גם
בוחר רצפים משם.
אנא עיין בתיעוד למטה למידע מפורט יותר.
תַקצִיר
fastaselect
אפשרויות
-בקובץ
שם קובץ המכיל את כל רצפי ה-fasta
- שם שם קובץ המכיל את כל שמות הרצפים לבחירה
-תיק שם
שם הקובץ לאן לכתוב רצפים נבחרים
השתמש ב-fastaselect באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net