זוהי הפקודה fdnadiste שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
fdnadist - תוכנית רצף חומצות גרעין Distance Matrix
תַקצִיר
fdnadist -סדר פעולות seqsetall -שיטה רשימה -גמא רשימה -nקטגוריות מספר שלם -ציון מערך
-קטגוריות נכסים [משקולות נכסים] -מקדם גמא לצוף
-invarfrac לצוף -טטרציו לצוף -תדירות מ לְמַתֵג -תדר בסיס מערך
[-נמוך יותר בוליאני] [-קריא אדם בוליאני] -תיק אוסף [-נתוני הדפסה בוליאני]
[-התקדמות בוליאני]
fdnadist עזרה
תיאור
fdnadist היא תוכנית שורת פקודה מבית EMBOSS ("האירופה מולקולרית ביולוגיה פתוחה
חבילת תוכנה"). זה חלק מקבוצת הפקודות "פילוגניה:רצף מולקולרי".
אפשרויות
קֶלֶט סעיף
-סדר פעולות seqsetall
קובץ המכיל יישור רצף אחד או יותר
-שיטה רשימה
ערך ברירת מחדל: דגם מרחק F84
-גמא רשימה
ערך ברירת מחדל: אין שימוש בפרמטרי הפצה
-nקטגוריות מספר שלם
ערך ברירת מחדל: 1
-ציון מערך
ערך ברירת מחדל: 1.0
-קטגוריות נכסים
קובץ של קטגוריות שיעור ההחלפה
משקולות נכסים
נוסף סעיף
-מקדם גמא לצוף
ערך ברירת מחדל: 1
-invarfrac לצוף
ערך ברירת מחדל: 0.0
-טטרציו לצוף
ערך ברירת מחדל: 2.0
-תדירות מ לְמַתֵג
ערך ברירת מחדל: Y
-תדר בסיס מערך
ערך ברירת מחדל: 0.25 0.25 0.25 0.25
-נמוך יותר בוליאני
ערך ברירת מחדל: N
-קריא אדם בוליאני
ערך ברירת מחדל: @($(method)==s?Y:N)
תְפוּקָה סעיף
-תיק אוסף
-נתוני הדפסה בוליאני
ערך ברירת מחדל: N
-התקדמות בוליאני
ערך ברירת מחדל: Y
השתמש ב-fdnadiste באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net