זוהי הפקודה gt-uniq שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
gt-uniq - סנן גרפים חוזרים של צומתי מאפיינים בקובץ GFF3 ממוין.
תַקצִיר
gt ייחודי [אפשרות ...] [GFF3_file]
תיאור
-v [כן|לא]
להיות מילולי (ברירת מחדל: לא)
-o [שם הקובץ]
הפנה פלט לקובץ שצוין (ברירת מחדל: לא מוגדר)
-gzip [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס של gzip (ברירת מחדל: לא)
-bzip2 [כן|לא]
כתוב קובץ פלט דחוס bzip2 (ברירת מחדל: לא)
כוח [כן|לא]
לכפות כתיבה לקובץ פלט (ברירת מחדל: לא)
עזרה
הצג עזרה וצא
-הפך
להציג מידע על הגרסה ולצאת
חציית עומק תחילה של גרף צומת תכונה מתחילה בצומת התכונה ברמה העליונה (או
פסאודו-צומת) וחוקר כמה שיותר לאורך כל ענף לפני שהוא חוזר אחורה. בואו
נניח שצמתי התכונה מאוחסנים ברשימה לפי סדר חצייתם (הנקרא
"רשימת צמתי התכונות").
שני גרפים של צומת מאפיינים נחשבים כחוזרים על עצמם אם רשימת צומת המאפיינים שלהם (מתוך
חציית עומק תחילה) בעלי אורך זהה וכל זוג צומת מאפיינים (משתי הרשימות ב
אותה תנוחה) היא "דומה".
שני צמתי מאפיינים הם "דומים", אם יש להם את אותו מזהה רצף, סוג מאפיינים, טווח,
גדיל ופאזה.
עבור גרף צומת תכונות חוזר שכזה, זה עם הציון הגבוה יותר (מהרמה העליונה
תכונה) נשמרת. אם רק לאחד מגרפי צומת התכונות יש ציון מוגדר, זה יהיה
שמר.
דיווח באגים
דווח על באגים לgt-users@genometools.org>.
השתמש ב-gt-uniq באינטרנט באמצעות שירותי onworks.net