זוהי הפקודה loadPulses שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות המרובות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS
תָכְנִית:
שֵׁם
loadPulses - מידע על פולסים ברצף עומס
תַקצִיר
loadPulses basFileName cmpFileName [אפשרויות]
תיאור
loadPulses טוענת מידע פולסים ברצף כגון מרחק בין פולסים או איכות
מידע לקובץ cmp.h5. זה מאפשר לנתח קינטיקה ואיכות
מידע לפי עמודת יישור.
אפשרויות
basFileName
הקלט {bas,pls}.h5 או input.fofn.
cmpFileName
קובץ cmp.h5 לטעינת מידע דופק.
-מדדים ערך
רשימה מופרדת בפסיקים של מדדים (ללא רווחים).
אפשרויות תקפות הן:
WhenStarted, QualityValue, InsertionQV, MergeQV, DeletionQV, DeletionTag,
SubstitutionTag, SubstitutionQV, PreBaseFrames, IPD, StartFrame, PulseWidth,
WidthInFrames, Light, pkmid, ClassifierQV, PulseIndex
אפשרויות ברירת המחדל הן:
QualityValue, ClassifierQV, StartFrame, PulseWidth, WidthInFrames, pkmid,
IPD
-failOnMissingData
צא אם שדות נתונים חסרים בקלט bas.h5 או pls.h5 שהם
נדרש לטעינת מדד. ברירת מחדל היא אזהרה.
-בקריאה
טען מידע דופק באמצעות מדדי קריאה במקום חציצה.
-בימטרי
טען מידע דופק לפי מדד ולא לפי קריאה. זה משתמש יותר בזיכרון מאשר
-בקריאה, אבל יכול להיות מהיר יותר.
-maxElements ערך
הגדר מגבלה על הגודל של קובץ pls/bas לאחסון איתו -בימטרי (ערך ברירת מחדל:
int מקסימום). להשתמש -בקריאה אם חריגה מהמגבלה.
-maxMemory ערך
הגדר מגבלה (ב-GB) בזיכרון לאגירת נתונים -בימטרי (ערך ברירת מחדל: 4
GB). להשתמש -בקריאה אם חריגה מהמגבלה.
-metaNElements ערך
הגדר מספר אלמנטים במטמון מטא נתונים לקריאת קובץ bas/bax/pls.h5.
-גולמיNElementsערך
הגדר מספר אלמנטים במטמון הנתונים הגולמיים לקריאת הקובץ bas/bax/pls.h5.
-rawChunkSize ערך
הגדר גודל נתח של מטמון נתונים גולמיים לקריאת הקובץ bas/bax/pls.h5.
השתמש ב-loadPulses באופן מקוון באמצעות שירותי onworks.net