זוהי פקודה פשוטה שניתן להריץ בספק האירוח החינמי של OnWorks באמצעות אחת מתחנות העבודה המקוונות החינמיות שלנו, כגון Ubuntu Online, Fedora Online, אמולטור מקוון של Windows או אמולטור מקוון של MAC OS.
תָכְנִית:
שֵׁם
פשוט - מונה הקילומטרים הברור מבוסס מערך
תַקצִיר
פשוט [-f|-r|-C] [-c דְחִיסָה] [-m mersize] -i קלט -o תפוקה
תיאור
פשוט הוא מונה סיביות פשוט מאוד. הוא מקצה מערך ענק של 32 סיביות, מאכלס את
מערך עם mers, ממיין וכותב את הפלט. הוא יקצה 4 בתים לכל kmer. k=16
ידרוש 16 ג'יגה-בייט כדי לפעול.
אפשרויות
-i קלט
-o תפוקה
-m mersize
גודל המר. ברירת המחדל היא 22
-f kmer קדימה (זוהי ברירת המחדל)
-r ק"מ הפוך
-C ק"מ קנוני (קטן יותר מבחינה לקסיקוגרפית מהק"מ הקדמי והאחורי בכל אחד מהם)
מִקוּם)
-c # דחיסת mer
השתמשו בשירותי onworks.net פשוטים באינטרנט