זוהי אפליקציית לינוקס בשם CTK, אשר את הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כ-Version1.1.5sourcecode.tar.gz. ניתן להריץ אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל אונליין את האפליקציה הזו בשם CTK עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צילומי מסך:
CTK
תיאור:
CTK (ערכת כלים CLIP) היא ערכת כלים לביולוגיה חישובית הממומשת בפרל, שנועדה לניתוח נתוני ריצוף CLIP. היא מציעה מערכת יעילה מקריאות גולמיות דרך קריאת שיא וגילוי מוטיבים.
תכונות
- מנתח קריאות CLIP-seq גולמיות ומבצע סינון איכותי
- מזהה אתרי מוטציה מושרים על ידי קישור צולב (CIMS)
- מזהה אזורים ושיאים של מוטיב RNA מועשר
- מפיק פורמטים סטנדרטיים של BED/narrowPeak
- ניתן להרחבה באמצעות סקריפטים של Perl (למשל tag2cluster, tag2collapse)
- תיעוד מקיף וקבוצת תמיכה פעילה למשתמשים
שפת תכנות
פרל
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מאתר https://sourceforge.net/projects/ctk.mirror/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להריץ אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.