זוהי אפליקציית לינוקס בשם ForceGen שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור ForceGenV0.4.jar. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם ForceGen עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צילומי מסך:
ForceGen
תיאור:
נא לצטט:ForceGen: גזירת קשר קוולנטי אטומי קבוע עבור Gromacs. Nash A, Collier T, Birch HL, de Leeuw NH. Journal of Molecular Modeling (2018), (24)5. DOI: 10.1007/s00894-017-3530-6
סרטון הדרכה:
https://youtu.be/fQVXv8Ge_tg
צנצנת ההפעלה הזו של Java גוזרת קבועי כוח קשר מסדר שני עבור מתיחה של קשר וזווית קשר מחישובים גאוסיים קוונטיים. החישובים תואמים למשפחת שדות הכוח הענבריים או לכל שדה כוח הנגזר מהטנזור מסדר שני של ההסיאן משברים מולקולריים. הפלט נעשה תואם לפורמט הטופולוגיה של Gromacs.
דוגמאות לשימוש כוללות גזירת קבועי כוח הקשר וערכי שיווי משקל עבור:
-מתכות קשורות באתרים פעילים בחלבון
-חומצות אמינו שעברו שינוי
-מולקולות קטנות/מולקולות תרופות
ניתן למצוא zip של קבצי דוגמאות על ידי לחיצה על הקישור "עיון בכל הקבצים".
נכתב על ידי ד"ר אנתוני נאש (אוקספורד)
בתמיכת ד"ר תומס קולייר, פרופ' הלן בירץ'
תכונות
- גזירת כוח מתיחה של קשר קבוע
- גזירת כוח זווית קשר קבועה
- תאימות לטופולוגיה של Gromacs
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/forcegen/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.