זוהי אפליקציית לינוקס בשם metawatt להפעלה מקוונת בלינוקס, שאת הגרסה האחרונה שלה ניתן להוריד כ- MetaWatt-3.5.3.zip. ניתן להפעיל אותה באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks לתחנות עבודה.
הורד והפעל באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם metawatt כדי להריץ אותה בלינוקס באופן מקוון עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צילומי מסך:
מטא-וואט להפעלה מקוונת בלינוקס
תיאור:
כלי ה-Metawatt binner הוא כלי binning גרפי המשתמש בסטטיסטיקה רב-משתנית של תדירות טטרנוקלאוטידים ובbinning מבוסס כיסוי דיפרנציאלי. הוא גם מבצע הערכה טקסונומית של איכות ה-binning (דרך diamond BLASTx). ניתן לערוך ולייצא bins שנוצרו במהירות. ה-Metawatt מיושם ב-Java SWING ותלוי באופן מינימלי ב-Diamond, HMMer3.1, BBMap, Prodigal וספריית Batik לצורך ייצוא גרפיקה של SVG.ציטוט: Strous M, Kraft B, Bisdorf R, TegetMeyer H (2012) חלוקה לקבוצות מטאגנומיות לפיזיולוגיה מיקרוביאלית של תרבויות מעורבות. Frontiers in Microbial Physiology and Metabolism 3:410. doi: 10.3389/fmicb.2012.00410
תכונות
- שילוב של טטרנוקלאוטידים וכיסוי דיפרנציאלי של קונטיגים מטאגנומיים
- ממשק משתמש גרפי לחקר נתונים
- יצירת פרופיל טקסונומי של פחים בעזרת Diamond blastp
- גילוי גנים משומרים בעלי עותק יחיד
- עצים פילוגנטיים של סלים המבוססים על גנים שמורים
- גרפי GC/כיסוי או כיסוי/כיסוי אינטראקטיביים
- פועל גם באופן אוטומטי לחלוטין בשורת הפקודה
קהל
מדע/מחקר
ממשק משתמש
Java Swing
שפת תכנות
Java
זוהי אפליקציה שניתן להוריד גם מ-https://sourceforge.net/projects/metawatt/. היא אוחסנה ב-OnWorks על מנת שניתן יהיה להפעיל אותה באופן מקוון בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.