זוהי אפליקציית לינוקס בשם RGAAT שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם RGAAT.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם RGAAT עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל את האמולטור המקוון של OnWorks Linux או Windows מקוון או אמולטור מקוון של MACOS מאתר זה.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Linux שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה, התקן אותה והפעל אותה.
צילומי מסך:
RGAAT
תיאור:
תוכנית זו יכולה להרכיב ו/או להוסיף הערות לגנום עבור גנום חדש ושדרוג גנום ידוע באמצעות קובץ יישור רצף (פורמט SAM או BAM), קובץ וריאציה של רצף (פורמט VCF או טבלת חמישה קולומים (מופרד בטאבים, כולל כרומוזום, מיקום, מזהה, הפניה) אלל ואלל חלופי)) או קובץ רצף גנום חדש (פורמט FASTA) המבוסס על קובץ רצף גנום ייחוס (פורמט FASTA) וקובץ ביאור (פורמט TBL, GTF, GFF, GFF3 או BED).
תכונות
- זיהוי וריאציות רצף
- בניית רצף קונצנזוס של הגנום
- שינוי הגנום
- השוואה של גנום
- ביאור הגנום
- בניית המרת תיאום גנום בין גרסאות הרכבה שונות של גנום
קהל
מדע/מחקר
שפת תכנות
פרל
כל הקטגוריות
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/rgaat/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.