זוהי אפליקציית Windows בשם MCPerm: Monte Carlo SNP תמורה להפעלה ב-Windows מקוון על לינוקס מקוונת שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בתור MCPerm_1.1.2.tar.gz. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והרץ באופן מקוון את האפליקציה הזו בשם MCPerm: Monte Carlo SNP תמורה להפעלה ב-Windows מקוון על לינוקס באינטרנט עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
MCPerm: תמורה של Monte Carlo SNP להפעלה ב-Windows מקוון על לינוקס מקוונת
תיאור:
MCPerm: שיטת פרמוטציה של מונטה קרלו עבור מתאם מבחנים מרובים במחקר קשר בין מקרה לביקורתמבחן תמורה מסורתית (TradPerm) היא שיטת ניתוח חשובה לא פרמטרית, שניתן להתייחס אליה כאל תקן הזהב לתיקוני בדיקות מרובים במחקר קשרי מקרה-ביקורת. עם זאת, הוא מסתמך על הגנוטיפים והפנוטיפים המקוריים של נוקלאוטידים בודדים (SNP) כדי לבצע מספר רב של עירובים אקראיים, ולכן הוא אינטנסיבי מבחינה חישובית, במיוחד עבור מחקר אגודות רחב של גנום (GWAS). כדי לשפר את מהירות החישוב מבלי לשנות את גודל ה-p-value של TradPerm, פיתחנו שיטת תמונת מונטה קרלו (MCPerm) כחלופה יעילה ל-TradPerm.
שיטות: MCPerm אינו צריך לערבב את נתוני הגנוטיפים והפנוטיפים המקוריים. הוא משתמש בשיטת מונטה קרלו, משתמש בהפצה היפרגיאומטרית דו-שלבית כדי ליצור את המספר האקראי של הגנוטיפים (AA, Aa ו-aa) במקרים ובבקרות.
שפת תכנות
S / R
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מ-https://sourceforge.net/projects/mcperm/. זה התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.