זוהי אפליקציית Windows בשם MetaPhat -meta-pheno-association-tracker שניתן להוריד את המהדורה האחרונה שלה בשם plasma_lipids_decomposed.zip. ניתן להפעיל אותו באופן מקוון בספק האירוח החינמי OnWorks עבור תחנות עבודה.
הורד והפעל באינטרנט את האפליקציה הזו בשם MetaPhat -meta-pheno-association-tracker עם OnWorks בחינם.
בצע את ההוראות הבאות כדי להפעיל את האפליקציה הזו:
- 1. הורד את היישום הזה למחשב שלך.
- 2. הזן במנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש שאתה רוצה.
- 3. העלה את היישום הזה במנהל קבצים כזה.
- 4. הפעל כל אמולטור מקוון של OS OnWorks מאתר זה, אך עדיף אמולטור מקוון של Windows.
- 5. ממערכת ההפעלה OnWorks Windows שזה עתה התחלת, עבור אל מנהל הקבצים שלנו https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX עם שם המשתמש הרצוי.
- 6. הורד את האפליקציה והתקן אותה.
- 7. הורד את Wine ממאגרי התוכנה שלך להפצות לינוקס. לאחר ההתקנה, תוכל ללחוץ פעמיים על האפליקציה כדי להפעיל אותם עם Wine. אתה יכול גם לנסות את PlayOnLinux, ממשק מפואר מעל Wine שיעזור לך להתקין תוכניות ומשחקים פופולריים של Windows.
Wine היא דרך להפעיל תוכנת Windows על לינוקס, אך ללא צורך ב-Windows. Wine היא שכבת תאימות של Windows בקוד פתוח שיכולה להריץ תוכניות Windows ישירות על כל שולחן עבודה של לינוקס. בעיקרו של דבר, Wine מנסה להטמיע מחדש מספיק של Windows מאפס כדי שהוא יוכל להריץ את כל יישומי Windows מבלי להזדקק ל-Windows.
צילומי מסך:
MetaPhat -meta-pheno-association-tracker
תיאור:
MetaPhat היא תוכנית בקוד פתוח לזיהוי תכונות משנה אופטימליות על אסוציאציות מובילות SNP מתוצאות סיכום GWAS של סמנים ביולוגיים מרובים. התכונות הטובות ביותר נגזרות מפירוק שיטתי של אסוציאציות רב-משתניות לתכונות מרכזיות המבוססות על BIC וערך P מיטביים ממודלים רב-משתנים של CCA. תוצאות עקבות SNP משורטטים ומקובצים במקבצים כדי לנתח ולשפר את הספציפיות של אסוציאציות פנוטיפ-גנוטיפ mv.
שוחרר עם פונקציית LD https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/files/Dist/meta_phat.tar.gz/download
התחלה מהירה https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Quick%20Start
תשומות https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Inputs
דוגמה ליפידים גלובליים https://sourceforge.net/p/meta-pheno-association-tracer/wiki/Installation_global_lipids
ציטוט: Lin et al. (2020) MetaPhat: זיהוי ופירוק של אסוציאציות רב-משתניות מסטטיסטיקות אגודות חד-משתניות ברחבי הגנום. חֲזִית. ג'נט. דואי: 10.
תכונות
- ניתוח תכונות של גנום רב משתני
- בחירת תת-קבוצה אופטימלית מבוססת ערך p ו-BIC
- עלילות עקבות פירוק תכונה
- אוכלוסייה וחסימות LD גוש
- lead SNP וקובץ סיכום תכונת נהג
- snp-snp תכונה דרגה אשכול חוד
זוהי אפליקציה שניתן להביא גם מאתר https://sourceforge.net/projects/meta-pheno-association-tracer/. הוא התארח ב-OnWorks על מנת להפעיל אותו באינטרנט בצורה הקלה ביותר מאחת ממערכות ההפעלה החינמיות שלנו.