これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドaltree-convertpです。
プログラム：
NAME
altree-convert - タイトル...
SYNOPSIS
altree-convert [オプション]
オプション：
--version プログラムのバージョン
--short-help|h 簡単なヘルプ メッセージ
--help オプションの説明を含むヘルプ メッセージ
--manの完全なドキュメント
--first-input-file|i 入力ファイル 1
--second-input-file|j 入力ファイル 2 (必須ではありません)
--output-file|o 出力ファイル
--case-control-output|c nb ケース/コントロールを含む出力
--データ型|t DNA|NUM
--phylo-prog|p PAUP|PHYLIP
--reconstruct-prog|r フェーズ|FAMHAP
--data-quali|q データの種類: 定性的または定量的
--nbind-threshold|s ハプロタイプを維持するために必要な個体の最小数
OPTIONS
- バージョン
プログラムのバージョンを出力して終了します。
--短いヘルプ
簡単なヘルプメッセージを印刷して終了します。
- 助けて オプションの説明を含むヘルプ メッセージを出力して終了します。
- 男 マニュアルページを印刷して終了します。
--最初の入力ファイル|i
入力ファイル 1 (ハプロタイプ再構築プログラムの出力)
--XNUMX 番目の入力ファイル|j
入力ファイル 2 (famhap の XNUMX 番目の出力または病気の状態を含むファイル)
--出力ファイル|o
出力ファイル
--case-control-output|c
各ハプロタイプを持つケースとコントロールの数を含む出力ファイル
--データ型|t "DNA"|"SNP"
データの種類: DNA (ATGCU) または SNP (0-1)
--phylo-prog|p "フィリップ"|"パパ"
系統再構成プログラム
再構築プログラム|r 「ファムハプ|フェーズ」
ハプロタイプ再構築プログラム
データ品質|q 「定性的|定量的」
分析されるデータの種類
nbind-threshold|s
ハプロタイプを保持するために必要な、そのハプロタイプを持つ個体の最小数
さらなる分析。 すべてのハプロタイプを保持したい場合は、これに 0 を影響する必要があります。
変数
DESCRIPTION
この プログラム 指定された入力ファイルを読み取り、
系統再構成ソフトウェア paup または phylip/paml
onworks.net サービスを使用してオンラインで altree-convertp を使用する