gmt-music-plot-mutation-relationp - クラウドでオンライン

これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MAC OSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのいずれかを使用して、OnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドgmt-music-plot-mutation-relationpです。

プログラム:

NAME


gmt music plot 変異関係 - 変異関係ツールの結果をプロットします

VERSION


この文書は、GMTミュージックプロット変異関係バージョン0.04(2016-01-01)について説明します。
23:10:19)

SYNOPSIS


gmt 音楽プロット 突然変異関係 --input-matrix=? --output-pdf=? [--skip-zero-mut-samples]
[--genes-to-plot=?] [--plot-genes-in-order-listed]

REQUIRED 議論


入力マトリックス String
突然変異関係ツールによって生成された遺伝子/サンプルマトリックス

出力-pdf String
プロットを描画するための出力PDFファイル

オプション 議論


ゼロミュートサンプルをスキップする ブーリアン
プロットする遺伝子に変異がないサンプルはプロットしない

指定されていない場合、デフォルト値「true」

スキップなしゼロミュートサンプル ブーリアン
skip-zero-mut-samples を 'false' にする

遺伝子をプロットする String
プロットする遺伝子のコンマ区切りリスト (例: DNMT3A,NPM1)

遺伝子をリスト順にプロットする ブーリアン
遺伝子をリスト順にプロットします。デフォルトでは降順でプロットされます。
突然変異の数で並べ替え

指定されていない場合のデフォルト値は 'false' (--noplot-genes-in-order-listed) です。

遺伝子を順番にプロットしない ブーリアン
plot-genes-in-order-listed を 'false' にする

DESCRIPTION


「music mutation-relation --mutation-matrix-file」を使用して生成された行列が与えられた場合、このツールは
相互排他性または一致を強調するプロットを生成します
事前に定義された遺伝子セットの変異状態。

onworks.net サービスを使用して gmt-music-plot-mutation-relationp をオンラインで使用する



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