これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windows オンライン エミュレーター、MAC OS オンライン エミュレーターなどの複数の無料オンライン ワークステーションの 2 つを使用して、OnWorks 無料ホスティング プロバイダーで実行できるコマンド pwoXNUMXxsf です。
プログラム:
NAME
pwo2xsf - pw.x 出力ファイルを XSF 形式に変換します
SYNOPSIS
pwo2xsf [特別オプション] 座標オプション [file]
DESCRIPTION
pwo2xsf ~から原子構造を抽出します PW.X 出力ファイルを作成し、XSF 形式で出力します。
構造データを標準出力に出力します。 のユーティリティプログラムです クリスデン パッケージ
(http://www.xcrysden.org/)、XSF がネイティブです クリスデン 構造 形式でアーカイブしたプロジェクトを保存します.
(http://www.xcrysden.org/doc/XSF.html).
If file が指定されていない場合は、標準入力が読み取られます。
特殊 オプション
-r 薄暗い
周期次元を次のように縮小します 薄暗いすなわち、 薄暗い = 2、1、または 0。
コーディネート OPTIONS
これらのオプションは、抽出する座標を指定します。 可能性は次のとおりです。
-IC file
--イニコル file
初期値、つまり入力されたイオン座標を抽出します。
-lc file
--最新のクール file
pw.x 出力ファイルから最新の出力イオン座標を抽出します。
-oc file
--optcoor file
「--latestcoor」と似ていますが、最適化された座標が存在する場合のみ抽出します。
他には何もありません。
-a file
--animxsf file
すべてのイオン ステップの座標を Animated-XSF として抽出します。
-nc file
--ネブコア PWアウト
から座標と力を抽出します。 PWアウト NEB (パス) 計算のファイル。
COPYRIGHT
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onworks.net サービスを使用してオンラインで pwo2xsf を使用する