これは GENIE (GEne-geNe IntEraction) という名前の Linux アプリで、最新リリースは GENIE_src.tar としてダウンロードできます。 ワークステーション用の無料ホスティング プロバイダー OnWorks でオンラインで実行できます。
GENIE (GEne-geNe IntEraction) という名前のこのアプリを OnWorks で無料でオンラインでダウンロードして実行します。
このアプリを実行するには、次の手順に従ってください。
-1。このアプリケーションをPCにダウンロードしました。
--2。ファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXに必要なユーザー名を入力します。
-3。このアプリケーションをそのようなファイルマネージャにアップロードします。
-4。このWebサイトからOnWorksLinuxオンラインまたはWindowsオンラインエミュレーターまたはMACOSオンラインエミュレーターを起動します。
-5。起動したばかりのOnWorksLinux OSから、必要なユーザー名でファイルマネージャーhttps://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXXにアクセスします。
-6。アプリケーションをダウンロードし、インストールして実行します。
GENIE (GENe-gene インタラクション)
説明：
多数のSNPが関与している場合、遺伝子関連研究における遺伝子間相互作用は計算集約的です。 最新の中央処理装置（CPU）のほとんどには複数のコアがありますが、グラフィックス処理装置（GPU）にも数百のコアがあり、最近ではより高速な科学ソフトウェアの実装に使用されています。 ただし、現在、ユーザーがバイナリ特性の遺伝子相互作用分析にこれらのマルチコアデバイスの計算能力を十分に活用できるようにする遺伝子分析ソフトウェアパッケージはありません。
ここでは、相互作用分析を並列化するために複数のGPUまたはCPUプロセッサコアの能力を利用する新しいソフトウェアパッケージGENIEを紹介します。
引用：Chikkagoudar、S.、Wang、K。、＆Li、M。（2011） GENIE：複数のGPUまたはCPUコアを使用した遺伝子関連研究における遺伝子-遺伝子相互作用分析用のソフトウェアパッケージ。 BMCリサーチノート、4（1）、158。
Audience
科学/研究
プログラミング言語
C
カテゴリー
これは、https：//sourceforge.net/projects/gpugenie/からも取得できるアプリケーションです。 無料のオペレーティングシステムのXNUMXつから最も簡単な方法でオンラインで実行するために、OnWorksでホストされています。